1-4世代

 作品共四個世代，每世代都有新的初選神奇寶貝，他們都不可在野外捕獲，有關他們的棲息地都不明，但每世代都可從研究所取得。每個世代都有不同的宿敵，他們都會用初選神奇寶貝，並用對我方不利的屬性，他們都會不時突擊玩家。只要打敗遊戲的所有高手，便算勝出，而收服神奇寶貝往往是更重要的，每世代都有稀有的神奇寶貝，在遊戲要千方百計，走進崎嶇的地方才能捕獲，有些更要參加活動，得到道具後才有遇見的機會。

第一世代

神奇寶貝的傳說開始展開，遊戲主機為gameboy，地圖為關東地區，下為主要版本

• 神奇寶貝紅綠版：使用GB主機，1996年2月發售。（歐美地區未推出綠版）

   神奇寶貝藍版 使用GB主機，1996年首次於日本地區限量推出，1999年10發售。

• 神奇寶貝皮卡丘版：又稱黃版，使用GB主機，1998年9月12日發售。
• 神奇寶貝數目：151
• 初選神奇寶貝：妙蛙種子、小火龍、傑尼龜(紅綠藍版) / 皮卡丘(黃版)。
• 傳說神奇寶貝：急凍鳥、閃電鳥、火焰鳥、超夢。
• 幻之神奇寶貝：夢幻。
• 反派組織：火箭隊。

 第二世代 

二世代的遊戲在Game Boy Color上遊戲，地圖為城都及關東地區，包括以下版本

• 神奇寶貝 金銀版：使用GB/GBC主機，1999年11月發售。
• 神奇寶貝 水晶版：使用GBC主機，2000年12月14日發售。
• 神奇寶貝數目：251種。
• 新增神奇寶貝數目：100種。
• 初選神奇寶貝：菊草葉、火球鼠、小鋸鱷。
• 傳說神奇寶貝：雷公、炎帝、水君、洛奇亞、鳳王。
• 幻之神奇寶貝：雪拉比。
• 反派組織：火箭隊餘黨。
• 此代開始，神奇寶貝有自己的性別，可繁殖新的神奇寶貝。屬性相剋出現變化，增加了惡和鋼系。神奇寶貝有親密度，是某些神奇寶貝進化的關鍵。戰鬥方面，防禦分開了兩項--物防和特防。另外值得一提的是，從水晶開始，主人公變成男女各一位可選。

第三世代（2002年11月-2006年8月）

神奇寶貝第三世代(超世代)，主要在Game Boy Advance遊戲，地圖主要為芳緣（豐緣地區(紅藍綠寶石版)/關東地區&七之島(火紅葉綠版)，包含以下

神奇寶貝 紅藍寶石版 :使用GBA主機，2002年11月21日發售。

• 神奇寶貝火紅葉綠：使用GBA主機，為紅綠兩版的復刻作，2004年1月發售。
• 神奇寶貝 綠寶石版：使用GBA主機，2004年9月16日發售。
• 神奇寶貝數目：豐緣圖鑑202隻/全國圖鑑386隻。
• 新增神奇寶貝數目：135種。
• 初選神奇寶貝：木守宮、火稚雞、水躍魚(紅藍綠寶石)/ 妙蛙種子、小火龍、傑尼龜(火紅葉綠)。
• 傳說神奇寶貝：雷吉洛克、雷吉艾斯、雷吉斯奇魯、拉帝亞斯、拉帝歐斯、蓋歐卡、固拉多、烈空座(紅藍綠寶石)/急凍鳥、閃電鳥、火焰鳥、超夢、雷公、炎帝、水君^[1](火紅葉綠)。
• 幻之神奇寶貝：夢幻、洛奇亞、鳳王、基拉祈、代歐奇希斯。
• 反派組織：火岩隊、水艦隊(紅藍綠寶石)/火箭隊(火紅葉綠)
• 從此代開始，除遊戲畫面出現重大改變，也增加了特性、性格等因素，此外還有神奇寶貝的華麗度，藉此參加華麗大賽。戰鬥環境也受當地天氣影響，戰鬥環境除了可改變神奇寶貝的戰鬥力外，還可以改變招式的效果。

第四世代

第四世代的遊戲主要在nds上面遊戲，並可藉由Wi-Fi和全球連線。地圖為神奧地區(DPPt)/城都地區及關東地區(hgss)，以下為主要版本列表

• 神奇寶貝 鑽石珍珠版：使用NDS主機，2006年9月28日發售。
• 神奇寶貝 白金版‎：使用NDS主機，2008年9月13日發售。
• 神奇寶貝 心金・靈銀版：使用NDS主機，金銀兩版的重製作，2009年9月發售。
• 神奇寶貝數目：神奧151隻/白金210隻/城都256隻/全國493隻。
• 新增神奇寶貝數目：107種。
• 初選神奇寶貝：草苗龜、小火焰猴、波加曼(鑽石珍珠白金版)/菊草葉、火球鼠、小鋸鱷(心金魂銀)。
• 傳說神奇寶貝：急凍鳥、閃電鳥、火焰鳥^[4]、雷吉洛克、雷吉艾斯、雷吉斯奇魯^[5]、由克希、艾姆利多、亞克諾姆、帝牙盧卡、帕路奇犽、席多藍恩、雷吉奇卡斯、騎拉帝納^[6]、克雷色利亞(鑽石珍珠白金版)/急凍鳥、閃電鳥、火焰鳥^[7]、超夢、雷公、炎帝、水君、洛奇亞、鳳王、拉帝亞斯、拉帝歐斯、蓋歐卡、固拉多、烈空座^[8]、帝牙盧卡、帕路奇犽、騎拉帝納^[9]。(心金魂銀版)
• 幻之神奇寶貝：夢幻、雪拉比、霏歐納、瑪納霏、達克萊伊、潔咪、阿爾宙斯。
• 反派組織：銀河隊(鑽石珍珠白金版)/火箭隊餘黨(心金魂銀版)